הזדהות משרד החינוך 
"כדי להצליח ללמד ילדים איננו זקוקים לכישרון אלא לקשר
איננו זקוקים לניסיון אלא לנסות
איננו זקוקים להשוות אלא למצוא את המיוחד
איננו זקוקים לתוצאות אלא לדרך
איננו זקוקים להצלחה אלא להתקדמות"..
בית ספר מעבר אפק הינו בי"ס אזורי קיבוצי. תפקידנו להבנות סביבה מאפשרת ומטפחת, מערכת שייכות ותמיכה, במטרה לקדם את הלומדים למיטבם האישי, הלימודי והחברתי. כבי"ס מוביל פדגוגיה איכותית אנו מבססים את תהליכי הלמידה-הוראה על עיקרון פדגוגי: "למידה מאתגרת המזמנת בחירה לקידום מסוגלות אישית." אחד היישומים הוא הקמפוס הקיבוצי – מערך של קורסים אקדמיים המציעים ללומד ולמלמד בחירה מתוך מגוון ואתגר ויתרמו לפיתוח בוגר בעל מסוגלות וחוסן, מעורב ותורם לקהילה.
דברים שטוב וטוב שיש
- מרחבי למידה מגוונים, כיתתיים וחוץ-כיתתיים
- אווירה קיבוצית – משפחתית ושיח בגובה העיניים
- קמפוס למידה אקדמי : תלמידים בוחרים ממגוון של קורסים בתחומי הדעת השונים.
- עמלנות – שילוב תוכניות לימוד דוגמת גינה, סריגה, נגרות ומטבח לימודי
- אוטונומיה למורים בהובלת יוזמות פדגוגיות והעשרת התוכן
